Jerusalém, primavera do ano 33. Uma multidão reúne-se às portas da cidade para receber Jesus de Nazaré, que se prepara para celebrar a Páscoa com os seus apóstolos e seguidores. Com uma mensagem revolucionária, ele conquistou adeptos em todos os lugares, mas também olhares desconfiados entre as autoridades religiosas. A Última Ceia acontecerá em breve e o destino de um dos personagens mais influentes da história da humanidade será selado.

Em Ierusalem Anno Domini, cada jogador representa uma das comunidades de seguidores de Jesus de Nazaré que, tendo chegado a Jerusalém de cidades e aldeias próximas, querem aproximar-se do local da Última Ceia e colocar-se o mais próximo possível dos assentos de Jesus e dos seus apóstolos. Ao longo do jogo, os jogadores irão administrar recursos, fazer favores ou acumular parábolas.

O objetivo do jogo é somar pontos graças aos seguidores: quanto mais próximos estiverem dos apóstolos e do próprio Jesus, maior será o número de pontos de vitória que proporcionarão ao final do jogo (exceto os próximos de Judas, que pelo contrário irá subtrair pontos). As fichas de parábola que acumulamos ou as fichas de oferenda também adicionam pontos.